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Visualisierungsmethoden als Periodensystem

BioLektor — Thu, 24 Jun 2010 16:12:50 +0000

Wer sich für Methoden der Visualisierung von Daten, Informationen, Strategien usw. interessiert (und zudem Naturwissenschaftler ist), dürfte Freude am Periodensystem der Visualisierungsmethoden haben. Die ultimative Visualisierung der Visualisierungssysteme gewissermaßen.
Meines Wissens zuerst 2007 publiziert, habe ich nun auch eine sehr schöne Online-Umsetzung gefunden. Die einzelnen Beispiele erscheinen als mouseover-Effekt. Ich will das gar nicht lange beschreiben, probieren Sie es aus und finden Sie die Systematik der Anordnung heraus.

“Ausländische” Zeichen per “deutscher” Tastatur

BioLektor — Mon, 15 Mar 2010 21:49:23 +0000

In einen Text fremdsprachige Zeichen einfügen zu müssen, kommt gar nicht so selten vor. Eine Original-Zitat aus dem Tschechischen, eine Adresse in Schweden, ein Literaturbeleg auf Spanisch, ein mathematischer Ausdruck … und plötzlich benötigt man tschechische, schwedische, griechische oder spanische Buchstaben. Manche dieser fremdsprachigen Zeichen bedürfen nur eines Kringels, Häkchens oder Strichs (diakritische Zeichen) über einem der uns Deutschen bekannten 26 lateinischen Buchstaben, andere stehen auf dem Kopf (¡) oder sehen aus wie zwei miteinander verschmolzene Zeichen (Æ, Ligaturen), wieder andere sind uns völlig fremd.

Auf einer normalen deutschen QWERTZ-Tastatur ist alles, was über Zirkumflex, Akut und Gravis hinausgeht (und für Französisch noch halbwegs ausreicht), nicht zu finden. Was tun? Dem cleveren PC-Besitzer fallen dazu gleich mehrere (vermeintliche) Lösungsvorschläge ein.
Man könnte …

… sich auf der Suche nach Sonderzeichen durch die Zeichentabelle von Windows hangeln?
… das Tastaturlayout im Betriebssystem umstellen (und wieder zurück)?
… Programme besorgen, welche Bildschirmtastaturen für fremdsprachige Zeichen erzeugen?
… spezielle Schriftarten installieren und mit Tastaturschablonen hantieren?
… Transliterationstabellen für z.B. Kyrillisch studieren?
… ein Set von Tastaturen aus aller Welt kaufen und jeweils umstecken?
… Tastaturkürzel (ALT-Kodizes) auswendig lernen? (Tippen Sie z.B. mal ALT + 0198)
… das Zeichen säuberlich per Hand schreiben und einscannen?
… auf Webseiten in der gewünschten Sprache nach passenden Buchstaben suchen?
… eine internationalen Kommunikationsagentur beauftragen?

Deutlich einfacher ist es, die Seite www.typeit.org aufzurufen. Dort findet man anklickbare Tasten in verschiedenen europäischen Sprachen. Mann kann man nicht nur zwischen Dänisch, Esperanto, Finnisch, Französisch, Isländisch, Italienisch, Norwegisch, Polnisch, Portugiesisch, Russisch, Rumänisch, Schottisch, Schwedisch, Spanisch, Tschechisch, Türkisch, Ungarisch und Walisisch umschalten, sondern auch auf Währungssymbole (Bath, Shekel, Yen, Won u.a.), viele andere Symbole und das Internationale Phonetische Alphabet (Notation für die Aussprache).

Man „tippt“ dann per Maus einfach die gewünschten Zeichen an und diese erscheinen in einem Eingabebereich, in dem man auch „ganz normale“ Zeichen dazu tippen (oder auf Deutsch umstellen) kann. Der eingegebene Text bleibt sogar erhalten, wenn man die Sprache umstellt oder noch Symbole benötigt. Ist der Text komplett, kopiert man ihn per Maus oder Tastatur in die eigenen Dokumente, Texte, Mails, Adressfelder usw.
Ein schönes Online-Tool. Und so einfach. Einfach schön!

(gefunden im nicht nur wegen dieses Tipps lesenswerten Blog webwork-tools)

Paperbrain: Wir basteln uns ein Gehirn

BioLektor — Wed, 27 Jan 2010 18:55:16 +0000

Ein 3D-Anatomie-Modell des Gehirns zum Ausdrucken? Benötigt wird nur ein Drucker, eine Schere, Uhu und ein wenig Geduld und Geschick beim Basteln. Und voliá, so sieht mein fertiges Ergebnis aus:

Eine tolle Idee und super umgesetzt von Blogger Martin Pyka, der auch noch so freundlich ist, die in Blender als 3D-Modell erstellten Vorlagen als Bastelbögen im PDF-Format kostenlos zur Verfügung zu stellen. Eine schöne Sache für Medizin-, Biologie-, Psychologie-Studenten und jeden, der sich die Hirnregionen samt kurzer Funktionsbeschreibung schon immer mal genauer dreidimensional anschauen wollte. Da auch die Blender-Datei sowie SVG- und PNG-Formate mitgeliefert werden, kann man sich sogar den eigenen 3D-Hirnatlas nach Belieben selbst beschriften. Als Blender-Anfänger hat mich das begeistert und auch das Basteln der Papierform hat – wenngleich zum Schluss etwas pfriemelig – großen Spaß gemacht. Besten Dank, Herr Pyka!

Science 2.0

BioLektor — Wed, 14 Oct 2009 13:54:39 +0000

Was bringt das sogenannte Web 2.0 für Wissenschaftler? Welche Anwendungen lassen sich auch oder insbesondere für die Kommunikation unter Wissenschaftlern nutzen (immerhin die Personengruppe, die das WWW und das Internet überhaupt erst erfunden hat)? Spannende Fragen, man kommt derzeit kaum mit, wenn man all den diversen Tools, Systemen und Applikationen halbwegs auf dem neuesten Stand bleiben möchte. Vieles erinnert zwar an populäre Vorbilder wie Facebook, Mr. Wong oder YouTube, ist jedoch teilweise recht clever und nützlich an die Bedürfnisse der “Scientific Community” angepasst.
Hier mit Eigenzitaten einige in meinen Augen recht interessante Beispiele von Portalen und Werkzeugen, die von Wissenschaftlern genutzt werden oder speziell für Wissenschaftler entwickelt wurden:

Social Bookmarking
citeulike: „free service for managing and discovering scholarly references“

Social Cataloging
connotea: „free online reference management for all researchers, clinicians and scientists“
bibsonomy: „social bookmark and publication sharing system“
PublicationList: „let researchers and research organizations maintain a reliable web-based record of their academic output without any fuss“

Social Networking
researchgate: „scientific network that connects researchers“
Nature Network: „connecting scientists worldwide, with blogs, forums, and groups”
myExperiment: „find, use and share scientific workflows and other Research Objects“

Science Blogging
Science Blogs: „Where the world discusses science“

Science Wiki
OpenWetWare: „promote the sharing of information, know-how, and wisdom among researchers and groups”

Science Videos
Scivee: „Making Science Visible”
Jove: „Journal of Visualized Experiments“

Open Source, Open Data, Open Access
The Open Science Project: „encourage a collaborative environment in which science can be pursued by anyone who is inspired to discover something new about the natural world“

Science Online 2009 – Naturwissenschaftler und Web 2.0

BioLektor — Sat, 08 Aug 2009 08:35:07 +0000

Wie wirken Internet und Web 2.0 auf die Arbeit von Forschern, Wissenschaftsjournalisten, Bibliothekaren, Ausbildern, Studenten usw.? Wie lässt sich die wachsende Zahl verschiedenartiger Online-Tools effizient nutzen? Solchen Fragen geht die Konferenz Science Online 2009 nach, die am 22. August in London stattfindet und vom Nature Network veranstaltet wird. Spannende Themen werden geboten, u. a.:

Legal and Ethical Aspects of Science Blogging
Cat herding: The challenges and rewards of managing online scientific communities
Author identity – Creating a new kind of reputation online
Citizen science – How the web enables anyone to be a scientist

Leider ist eine direkte Teilnahme nicht mehr möglich, alle Karten zur Veranstaltung sind längst ausverkauft. Man kann jedoch dennoch an der Veranstaltung teilnehmen und ohne nach London zu reisen, da die Konferenz von der Nature Publishing Group (NPG) live in die virtuelle Welt von Second Life übertragen wird. Wie das funktioniert und wie man als Avatar in Second Life den Live-Stream der Veranstaltung (zum Programm) verfolgen, Fragen stellen und mitdiskutieren kann, wird auf „How to attend Science Online London in Second Life“ erklärt.

Riesige Moleküle in 3D-Welten

BioLektor — Mon, 20 Jul 2009 09:56:16 +0000

Spannend, was die Presseabteilung der Fraunhofer-Gesellschaft letzte Woche gemeldet hat: Die neue Software BioBrowser errechnet dreidimensionale Modelle von Molekülen und stellt diese auf dem Bildschirm dar. Das ist zunächst mal nix Neues, derartige Programme gibt es längst. Den Tüftlern von Fraunhofer Austria Visual Computing ist es offenbar jedoch gelungen, auch kompliziert gebaute Moleküle wie z.B. Proteine aus mehr als 50.000 Atomen darzustellen und das gestochen scharf. Die dreidimensionale Darstellung von Biomolekülen kann u.a. helfen bei der Erforschung der Wirkungsweise von Medikamenten, Impfstoffen oder Giften. Auf dem Bildschirm können die Moleküle gedreht, aus beliebigen Winkeln angeschaut und vergrößert werden.

Fraunhofer BioBrowser, (c) Fraunhofer Austria

Klingt vielversprechend, Interessierte Wissenschaftler, nicht nur aus Österreich, erhalten auf Anfrage einen Link zum Download. Nach Terminvereinbarung darf man seine Lieblingsmoleküle evtl. auf einer großen 3D-Projektionswand in Graz anschauen.
Kontakt per visual.computing@fraunhofer.at oder +43(0)316/873-5410.

–> zur vollständigen Meldung

–> mehr zum BioBrowser

Visualisierung komplexer biologischer Zusammenhänge

BioLektor — Wed, 10 Dec 2008 15:44:16 +0000

Die komplexen und teils komplizierten Strukturen von Organismen ansprechend grafisch darzustellen ist eine spannende Herausforderung. Ähnlich anspruchsvoll ist es, molekularbiologische oder biochemische Zusammenhänge zu visualisieren. Zu meiner Studienzeit war unter Biologiestudenten die riesige Faltkarte „BIOCHEMICAL PATHWAYS“ der Firma Boehringer Mannheim sehr beliebt.

Mit welchen grafischen und technischen Raffinessen heute biologische Phänomene, Strukturen, Wechselbeziehungen … im Grenzbereich zu Chemie und Physik optisch aufbereitet werden, dafür zeigt der Blog visualcomplexity einige sehr schöne Beispiele. (Für Motive aus der Biologie im Feld „Filter by“ rechts oben „Biology“ anwählen.)

Textstellen unwiderruflich schwärzen

BioLektor — Mon, 29 Sep 2008 19:00:10 +0000

Einige kennen vielleicht aus WORD 2003 das Redaction Add-In. Mit diesem Zusatzwerkzeug konnte man in WORD-Dateien Textstellen verstecken, d. h. man konnte Textpassagen, von denen man nicht wollte, dass andere Nutzer des Dokuments sie sehen sollten, durch Schwärzen komplett unleserlich machen. Dies war KEINE sogenannte Texthervorhebungsfunktion, die einfach Text mit einer Farbe hinterlegt, was jederzeit rückgängig gemacht werden kann, sondern der geschwärzte Text blieb auch nach Kopieren in andere Editoren wie Notepad komplett unlesbar.

Leider war diese Funktion weder in Office 2007 integriert noch bisher als Zusatztool oder Freeware erhältlich. Seit kurzem jedoch ist ein gleichartiges Word 2007 Redaction Tool erhältlich, welches sich in Office 2007 integriert. Das Tool ist „Open Source“ und noch in der Beta-Phase, aber sicherlich einen Test wert für jeden, der Texte mit sensiblen Daten im DOCX-Format ansonsten unverändert weitergeben will.

(gefunden in The Microsoft Office Word Team’s Blog)

Das Schlüsselwort in Ihrem Verstand?

BioLektor — Sat, 09 Aug 2008 09:25:41 +0000

Es ist im Grunde gar nicht witzig und viele haben sich darüber schon mokiert: das von automatischen Übersetzungstools produzierte Kauderwelsch. Doch manchmal sind die Erzeugnisse solche „Sprachverarbeitungssysteme“ derart skurril und schräg, dass man glauben könnte, es mit einer eigenen Kunstform zu tun zu haben. Gerade entdeckt:

“Ihre Web site zu mehr als 13 Sprachen übersetzen. Eine Optimierung und eine wirkungsvolle Web site für hohen Verkehr entwerfen.”

Ein hoher Anspruch und zumindest halbwegs verständlich, doch nun wird es drollig:

“Suche inneres Iconocast für das Schlüsselwort, das Sie im Verstand haben.
Wir glauben, wenn Sie inneres Iconocast suchen, Sie erhalten bessere Resultate als, das Netz alleine suchend.”

Alles klar? Ich geh denn mal mein inneres Iconodingens suchen … bessere Resultate haben will …

Online-Rechenknecht

BioLektor — Tue, 05 Aug 2008 18:19:06 +0000

So gut wie jeder PC hat eigene Taschenrechnerfunktionen, auch Online-Taschenrechner gibt es viele. Hervorheben möchte ich den virtuellen Taschenrechner eCalc, den es auch in der Version Scientific Calculator als Taschenrechner für Naturwissenschaftler gibt.

Das Online-Werkzeug rechnet nicht nur mit komplexen Zahlen, sondern wandelt außerdem Maßeinheiten um (s. dazu den Beitrag Konvertierungs-Tools für Einheiten aller Art), konvertiert Zahlen in andere Zahlensysteme (dezimal, oktal, hexadezimal, binär) und liefert einige für Naturwissenschaftler wichtige Konstanten. Wer unsicher ist, lässt sich vom Demo-Video die Bedienung anhand von Beispielen erläutern. Dass dieses kostenlose Online-Tool auch noch nett anzuschauen ist, macht es endgültig sympathisch.